分子蒸馏是一种特别的液--液分别技能，它不同于传统蒸馏依托沸点差分别原理，而是靠不同物质分子运动均匀安闲程的差异完成分别。当液体混合物沿加热板活动并被加热，轻、重分子会逸出液面而进入气相。　　

因为轻、重分子的安闲程不同，因而，不同物质的分子从液面逸出后移动距离不同，若能恰当地设置一块冷凝板，则轻分子到达冷凝板被冷凝排出，而重分子达不到冷凝板沿混合液排出。这样，到达物质分别的意图。　　

在沸腾的薄膜和冷凝面之间的压差是蒸汽流向的驱动力，关于细小的压力降会惹起蒸汽的活动。在1mbar下运转请求在沸腾面和冷凝面之间非常短的距离，根据这个原理制作的蒸馏器称为短程蒸馏器。短程蒸馏器（分子蒸馏）有一个内置冷凝器在加热面的对面，并使操作压力降到0.001mbar.　　

短程蒸馏器是一个作业在1~0.001mbar压力下热分别技能过程，它较低的沸腾温度，非常合适热敏性、高沸点物。其根本构成：带有加热夹套的圆柱型筒体，转子和内置冷凝器；在转子的固定架上精准装有刮膜器和防飞溅安装。内置冷凝器坐落蒸发器的中心，转子在圆柱型筒体和冷凝器之间旋转。